Der Stuhl ist in der Regel weich. Um einen Zylinder zu gewinnen braucht man keinen Diamantenbohrer. Ein Strohhalm genügt.

Wie man am besten Stuhlzylinder gewinnt erklärt eine spezielle Präsentation mit dem Namen „Stuhlprobenentnahme“. Auf dem folgenden Bild ist die Probenentnahme dargestellt. Ein etwa 4 mm großer Stuhlzylinder wird ausgestochen und zusammen mit dem Strohhalm in ein Röhrchen mit Fixierlösung eingebracht. In  jedes Röhrchen kommen zwei Strohhalme, die  aus verschiedenen Stellen der gleichen Stuhlprobe  entnommen werden. Die Fixierlösung besteht aus Alkohol und Essig. Und riecht stark nach Essig, hat aber den Vorteil, dass Proben in ihr bis zu einem Jahr bei Raumtemperatur haltbar sind. Man kann sich deswegen für die Probenentnahme den optimalen Zeitpunkt aussuchen. Ist der Stuhl zu flüssig, lohnt es sich abzuwarten, bis eine etwas dickere Probe kommt. Alkohol und Essig entziehen dem Stuhl Wasser, die weichen Proben werden dadurch hart. Selbst wenn der Stuhl zu flüssig ist sollte man,  falls es nicht anders möglich ist, eine Probe davon entnehmen. In dem  Alkohol/Essiggemisch bleiben einige Inseln sogar von flüssigem Stuhl strukturell intakt und können untersucht werden. Die Aussagekraft ist natürlich umso höher je vollständiger der Stuhlzylinder ist.