Die Entzündung findet zunächst nicht in der Darmwand, sondern außerhalb, an der Grenze zum Stuhl statt. Leukozyten, die Entzündungszellen des Körpers, wandern aus,  stellen sich an der Außenseite der Schleimschicht als Barriere auf und halten die Bakterien solange zurück wie die Schleimschicht durchlässig ist. Auf diese Weise bleibt die Entzündung lange Zeit von der Darmwand fern und man kann diese bei der Coloskopie oder in der Histologie nicht nachweisen.