Alle Barrieren sind zerstörbar. Der Zusammenbruch kann kurzzeitig sein, wie es bei Infektionen der Fall ist, oder anhaltend bei chronisch entzündlichen Darmerkrankungen. Das vorliegende Bild zeigt eine Gewebeprobe aus dem Dickdarm von einem Patienten mit M. Crohn. Bakterien durchwandern die Mukusbarriere, erreichen die Darmwand und sind sogar in einzelnen Zellen zu finden. Wenn Krankheiterreger die Darmoberfläche in großen Mengen erreichen, reagiert der Körper mit Reiz und Abwehrmaßnahmen. Unabhängig davon was die Ursachen der Störung sind, die allgemeinen Reaktionen darauf sind Durchfälle, Blähungen und Koliken. Bei Durchfällen wird die Keimzahl im Darm reduziert. Bei Blähungen “wirft“ der Darm den Stuhl von einer Wand zu anderen, als wäre dieser eine heiße Kartoffel, die man von einer Hand in die andere wirft. Mit Hilfe von Koliken wird die Bakterienmasse von den besonders empfindlichen Stellen weggeschoben. Reichen diese Maßnahmen nicht aus, kommt es zu einer Entzündung, die Bakterien tötet.